近親婚配對(duì)后代的影響，主要表現(xiàn)在增加隱性遺傳病的發(fā)病率，而且先天畸形、早產(chǎn)和流產(chǎn)、幼兒夭折的風(fēng)險(xiǎn)也增加。近親結(jié)婚使常染色體隱性遺傳病發(fā)病的機(jī)會(huì)增高，常見的有溶酶體貯積癥如糖原貯積癥、脂質(zhì)貯積癥、粘多糖貯積癥；合成酶的缺陷如血γ球蛋白缺乏癥、白化?。槐奖虬Y；肝豆?fàn)詈俗冃裕╓ilson?。?；半乳糖血癥；遺傳性聾等。伴X隱性遺傳病有：血友病、紅綠色盲癥、魚鱗病。每個(gè)正常人身上可能攜帶有幾個(gè)甚至十幾個(gè)有害的隱性等位基因，人類的核基因組一半來(lái)自父親，一半來(lái)自母親，在近親通婚的情況下，兩個(gè)相同有問題的基因結(jié)合到一起的機(jī)會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于非近親通婚的人。近親結(jié)婚還可以使多基因遺傳病發(fā)病率增高，常見的有腦積水、脊柱裂、無(wú)腦兒、精神分裂癥、先天性心臟病、癲癇等。據(jù)統(tǒng)計(jì)，多基因病近親結(jié)婚子女發(fā)病率約為.64%，非近親結(jié)婚子女發(fā)病率僅為0.57%。